Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms