Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhobtb3Q9CTN4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms