Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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