Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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