Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms