Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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PompQ9CQT5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PompQ9CQT5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PompQ9CQT5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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PompQ9CQT5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms