Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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