Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nudt21Q9CQF3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms