Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms