Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2a1Q99PM3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2a1Q99PM3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms