Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms