Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmed9Q99KF1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
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