Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Usp11Q99K46 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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