Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Def8Q99J78 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms