Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Apobec3Q99J72 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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