Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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