Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms