Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b3Q921M3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b3Q921M3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b3Q921M3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b3Q921M3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b3Q921M3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b3Q921M3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b3Q921M3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b3Q921M3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b3Q921M3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b3Q921M3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b3Q921M3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b3Q921M3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b3Q921M3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b3Q921M3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b3Q921M3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b3Q921M3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b3Q921M3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b3Q921M3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms