Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usb1Q91W78 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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