Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd3Q91W18 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms