Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sh3bgrl3Q91VW3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms