Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Vsx1Q91V10 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Vsx1Q91V10 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Vsx1Q91V10 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Vsx1Q91V10 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Vsx1Q91V10 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Vsx1Q91V10 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Vsx1Q91V10 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Vsx1Q91V10 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vsx1Q91V10 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vsx1Q91V10 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vsx1Q91V10 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vsx1Q91V10 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vsx1Q91V10 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vsx1Q91V10 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vsx1Q91V10 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vsx1Q91V10 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vsx1Q91V10 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vsx1Q91V10 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vsx1Q91V10 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vsx1Q91V10 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vsx1Q91V10 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Vsx1Q91V10 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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