Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul7Q8VE73 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms