Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx18Q8VDS8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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