Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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