Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Fam20bQ8VCS3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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