Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ubxn4Q8VCH8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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