Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RfxapQ8VCG9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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