Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Top1mtQ8R4U6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Top1mtQ8R4U6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Top1mtQ8R4U6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Top1mtQ8R4U6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Top1mtQ8R4U6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Top1mtQ8R4U6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Top1mtQ8R4U6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top1mtQ8R4U6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Top1mtQ8R4U6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Top1mtQ8R4U6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Top1mtQ8R4U6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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