Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf4Q8R368 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms