Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms