Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CipcQ8R0W1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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