Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf183Q8QZS5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf183Q8QZS5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf183Q8QZS5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rnf183Q8QZS5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rnf183Q8QZS5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rnf183Q8QZS5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rnf183Q8QZS5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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