Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms