Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Abcf3Q8K268 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Abcf3Q8K268 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Abcf3Q8K268 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Abcf3Q8K268 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Abcf3Q8K268 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms