Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.7 ms