Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn34c1Q8K193 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn34c1Q8K193 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn34c1Q8K193 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn34c1Q8K193 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn34c1Q8K193 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn34c1Q8K193 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn34c1Q8K193 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn34c1Q8K193 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Cldn34c1Q8K193 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Cldn34c1Q8K193 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Cldn34c1Q8K193 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Cldn34c1Q8K193 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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