Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms