Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tshz3Q8CGV9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms