Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdkl1Q8CEQ0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms