Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tsr2Q8C8T8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tsr2Q8C8T8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tsr2Q8C8T8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tsr2Q8C8T8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tsr2Q8C8T8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tsr2Q8C8T8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsr2Q8C8T8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms