Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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