Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Sfrp1Q8C4U3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Sfrp1Q8C4U3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfrp1Q8C4U3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms