Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg16l1Q8C0J2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg16l1Q8C0J2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg16l1Q8C0J2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg16l1Q8C0J2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atg16l1Q8C0J2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atg16l1Q8C0J2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atg16l1Q8C0J2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atg16l1Q8C0J2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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