Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccser1Q8C0C4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccser1Q8C0C4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccser1Q8C0C4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccser1Q8C0C4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccser1Q8C0C4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccser1Q8C0C4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccser1Q8C0C4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccser1Q8C0C4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccser1Q8C0C4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccser1Q8C0C4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccser1Q8C0C4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccser1Q8C0C4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccser1Q8C0C4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccser1Q8C0C4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccser1Q8C0C4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccser1Q8C0C4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms