Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Triml1Q8BVP1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Triml1Q8BVP1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms