Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snx17Q8BVL3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snx17Q8BVL3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snx17Q8BVL3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx17Q8BVL3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms