Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdcl3Q8BVF2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms