Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pggt1bQ8BUY9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pggt1bQ8BUY9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pggt1bQ8BUY9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pggt1bQ8BUY9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pggt1bQ8BUY9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pggt1bQ8BUY9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pggt1bQ8BUY9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Pggt1bQ8BUY9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Pggt1bQ8BUY9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Pggt1bQ8BUY9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Pggt1bQ8BUY9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Pggt1bQ8BUY9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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