Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pum3Q8BKS9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms